用于数据驱动的科学的开源工具

知识共享是科学进步的重要推动力。EPFL的蓝脑计划采用开放科学方法,创建并开源了蓝脑Nexus,该开源平台允许构建数据集成平台。Blue Brain

知识共享是科学进步的重要推动力。EPFL的“蓝脑计划”采用开放科学方法,创建并开源了“蓝脑Nexus”,该开源平台允许构建数据集成平台。Blue Brain Nexus通过搜索,集成和跟踪大规模数据和模型来实现数据驱动的科学。

用于数据驱动的科学的开源工具

EPFL的Blue Brain Project已宣布发布其开源软件项目“ Blue Brain Nexus”,该项目旨在实现神经科学和更广泛的科学界的FAIR(可查找,可访问,互操作和可重用)数据管理原则。它是EPFL开放科学计划的一部分,该计划旨在最大限度地扩大在学校进行的研究的范围和影响。

蓝脑计划的目的是为啮齿动物的大脑以及最终的人脑建立准确的,生物学上详细的数字重建和模拟。Blue Brain Nexus在支持Blue Brain数据驱动的建模周期的所有阶段都发挥了作用,包括但不限于实验数据,单细胞模型,电路,仿真和验证。大脑是一个复杂的多层次系统,是我们当今最大的“大数据”问题之一。因此,Blue Brain Nexus旨在组织,存储和处理异常大量的数据并支持大量用户的使用。

Blue Brain Nexus的核心是知识图,它充当数据存储库和元数据目录。通过允许用户设计任意域,它仍然与要表示的域无关,这使其他科学计划(如天文学,医学研究和农业)能够将Blue Brain Nexus用作其数据平台的核心。Blue Brain Nexus服务已经在评估是否可以集成到Human Brain Project的Neuroinformatics平台中。

Blue Brain Nexus的知识图谱专门针对实现科学进步而做出的贡献,将其起源视为头等公民,从而促进了对数据来源​​及其使用方式的跟踪。这使用户能够评估数据的质量,从而使他们建立信任。Blue Brain Nexus的另一个关键功能是其语义搜索功能,该功能可将搜索与数据及其来源集成在一起,从而使科学家能够轻松地发现和访问新的相关数据。

EPFL教授肖恩·希尔(Sean Hill)说道:“我们看到几乎所有科学都在以数据为主导。Blue Brain Nexus代表了多年研究的成果,旨在构建最先进的语义数据管理平台。我们迫不及待地想看看社区将如何使用Blue Brain Nexus。”

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