对狗基因组的分析将提供对人类疾病的洞察力

2018年12月31日10:51:11 发表评论
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v根据由基因组分析中心(TGAC)领导的一项新研究,犬类基因组的非编码RNA是研究人类疾病的重要模型,是进化和生物医学研究的重要起点。今天发…

v根据由基因组分析中心(TGAC)领导的一项新研究,犬类基因组的非编码RNA是研究人类疾病的重要模型,是进化和生物医学研究的重要起点。

今天发表在PLOS ONE上的新研究揭示了狗基因组中microRNA的改进注释,以进一步了解其生物学作用。为将来研究生物医学,进化和重要动物(包括狗,牛,马和猪)的驯化提供平台。

微小RNA(miRNA)是小的非编码RNA分子,其在调节动物和植物中的基因表达中起关键作用。使用最新的狗基因组装配和9种不同狗组织的小RNA序列,包括皮肤,血液,卵巢和睾丸,来自TGAC的科学家已经鉴定出91种新型miRNA。

这一发现提供了一个重要的机会,不仅可以增强我们对miRNA如何调节用于研究人类疾病的重要模型物种中的各种生物过程的理解,而且可以导致对miRNA在动物驯化中所起作用的进一步类似研究。

来自TGAC脊椎动物和健康基因组学的首席研究员Luca Penso Dolfin博士说:“由于miRNA在编排各种细胞过程中非常重要,因此这91种新型miRNA的发现为探索其潜在的主要影响提供了重要的起点。基因调控。“

总体而言,Penso-Dolfin博士分析了811个miRNA:91个新的microRNA序列和720个保守的(即,对其他生物共有)。在这些保守的基因座中,207个先前未被鉴定为犬microRNA。

Penso-Dolfin博士补充说:“我们的结果代表了我们对狗基因组知识的明显改善,为进一步研究基因调控的进化以及microRNA对病理状况的贡献铺平了道路。我们现在正在寻找额外的狗和各种农场动物的数据,将microRNA发现与其在驯化中可能发挥作用的研究结合起来。“

家犬Canis familiaris是狼(Canis lupus)驯化的结果,它起源于大约1万年前。从那时起,人工选择了数百种犬种,导致形态和行为变异程度非常高。自从狗出现以来,它与人类共享环境,已经暴露于类似的病原体,因此代表了人类疾病研究的重要模型系统。

最新的Canine基因组构建和注释的发布,CanFam3.1提供了一个机会,可以增强我们对狗模型系统中组织间基因调控的理解。

本研究由TGAC与美国Broad研究所和瑞典乌普萨拉大学合作领导。题为“改进的犬基因组microRNA注释”的论文发表在PLOS ONE上。TGAC科学主任Federica Di Palma教授和TGAC监管基因组学小组组长Simon Moxon博士是共同作者。

TGAC由BBSRC策略性资助,并运营国家能力,以促进基因组学和生物信息学的应用,推动生物科学研究和创新。

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