标准病理学测试优于膀胱癌的分子亚型分析

尽管试图开发一种相对简单,廉价的方法,以使医生及其膀胱癌患者更好地了解可能的结局和最佳治疗方案,但科学家们发现,为此而设计的先进的…

尽管试图开发一种相对简单,廉价的方法,以使医生及其膀胱癌患者更好地了解可能的结局和最佳治疗方案,但科学家们发现,为此而设计的先进的新分型技术无法提供比长期病理更好的信息。测试。

标准病理学测试优于膀胱癌的分子亚型分析

他们研究了肌肉浸润性膀胱癌患者的几组癌症标本数据,这是一种与高死亡率相关的高度癌症。数据集包括用于确定新兴的分子亚型的数据集,并具有关于患者的结局信息。

他们一致地发现,目前提供给患者的膀胱肿瘤的分子亚型在病理学家长期使用的将癌症定性为低或高级别并确定其侵袭到膀胱壁的程度的标准测试中表现要好。他们在一项围绕《泌尿外科杂志》封面刊登的研究中进行了报道,包括脂肪,淋巴结,血管及其周围的脂肪。

奥古斯塔大学乔治亚大学医学院生物化学与分子生物学系主任Vinata B. Lokeshwar博士说:“肌肉浸润性膀胱癌具有侵袭性,通常预后很差。”“每个人都在尝试找出如何改善诊断,治疗和生存的方法。”

该研究的通讯作者,Lokeshwar表示:“对患者肿瘤进行基因特征分析绝对有价值,可以使您发现生长和转移的驱动因素,从而帮助指导该患者的治疗,即使这有助于确定新的治疗目标。”佐治亚癌症中心。“但是利用这些信息将肿瘤亚型化似乎并没有增加对患者的诊断或预后价值。”

相反,研究人员建议在使用分子亚型来帮助指导患者护理之前,需要进行更多的研究。

不断发展的诊断方法包括根据癌症类型中存在的基因表达和突变来汇编数据库,以找到基因表达模式,然后将其用于“在病理学上相似但在分子上不同”的肿瘤亚型。这个想法是,分子亚型可以更好地指示哪些癌症更具侵略性,并有助于指导治疗选择,例如在手术前去除患病膀胱的化学疗法是否更好。

这是RNA测序或RNA-Seq,以及来自多种癌症的联邦遗传材料数据库,它使全球的研究人员能够检查特定肿瘤类型中的基因表达,以寻找与之相关的某些基因的共同表达。特定的临床结果。首先确定了肌肉浸润性膀胱癌的两种亚型,即腔室预示着更好的生存和基础型,预示着较差的预后,现在已经出现了六种亚型。关于肌肉浸润性膀胱癌亚型的第一篇论文发表于2014年《自然》杂志上。

但是,在寻找更简单,更便宜,可广泛获得的测试以提供相似见解的过程中,研究人员发现,这些新兴的亚型在通常的临床参数(例如肿瘤的等级以及其扩散到淋巴结或血管)方面的表现要好。

他们的工作认真地开始了,由研究生Daley S. Morera和Sarrah S. Lahorewala对患者的数据集以及用于识别分子亚型的不同分类方法进行了详尽的审查。

他们发现了11种在所有亚型分类方法中都通用的基因。他们认为,如果他们打算开发一种广泛可用的测试,那么基于这些常见基因的亚型可能就足够了。他们决定将他们的新子类型面板称为MCG-1。

Lokeshwar说,他们没有使用花费几千美元的RNA-Seq,而是使用了价格不到10美元的现成的逆转录定量PCR方法,该方法还着眼于基因表达,实际上用于验证RNA-Seq数据。

他们首先研究了自己的52例膀胱癌患者队列,其中39例患有肌肉浸润性疾病。他们发现MCG-1在预测重要指标(如转移可能性)方面的准确度仅为31-36%;特定疾病的生存率,意味着尚存膀胱癌;或总体生存期,即从癌症诊断或治疗开始直至研究结束的所有死亡原因的生存期。

认识到他们使用的数据集相对较小并且他们没有使用RNA-Seq进行分析,因此他们使用了癌症数据库ONCOMINE的三个患者数据集,其中有更多的患者-151名患有肌肉浸润性膀胱癌的患者,并且还使用了RNA -Seq查看基因表达。

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